克山病的病因目前还不完全清楚，可分生物地球化学病因和生物病因两种。

 

  生物地球化学病因认为与人体内外环境低硒、维生素E缺乏、蛋白质和氨基酸缺乏、膳食高锰、膳食

低钙等有关。

 

  生物病因学说认为克山病可能是由病毒、尤其是肠道病毒感染或食物真菌毒素中毒引起。也有人认为病毒感染与病区水土、营养因素有协同作用而致病。 

 

   总之，本病病因未完全明确，可能在低硒的基础上，各种综合因素参与相互作用而致病。